1. บริหารจัดการการศึกษาด้วยความเป็นมืออาชีพในระดับเชี่ยวชาญเฉพาะด้านทางการเกษตรสุขภาวะและศาสตร์การเรียนรู้ในทุกด้าน และพัฒนา ให้มาตรฐานการศึกษาในระดับสากล เพื่อการผลิตและพัฒนานักศึกษาให้เป็นบัณฑิตที่มีความรู้ ทักษะการเรียนรู้ในศตวรรษที่ 21 (ภาษาต่างประเทศ ทักษะเทคโนโลยี ทักษะการสร้างสรรค์นวัตกรรม (นวัตกรรมการเกษตร)) มีคุณธรรมจริยธรรม มีจิตสำนึกและความรับผิดชอบต่อสังคมประเทศ และมีความสมบูรณ์ในสมรรถนะทางการเกษตรสุขภาวะที่โดดเด่นศึกษาและวิจัยด้านการเกษตรสุขภาวะ (well being) เพื่อพัฒนาวิชาการและวิชาชีพ ให้สอดคล้องกับยุทธศาสตร์การพัฒนาประเทศ
2. ศึกษาและวิจัยด้านการเกษตรสุขภาวะ (agricultural well-being) เพื่อพัฒนาวิชาการ วิชาชีพ เศรษฐกิจ และสร้างสรรค์นวัตกรรมที่มีคุณค่า และมูลค่าที่สอดคล้องกับยุทธศาสตร์การพัฒนาภาคใต้ และหนุนเสริมการพัฒนาเศรษฐกิจ สังคม และสิ่งแวดล้อมของประเทศที่ยั่งยืน
3. การบริการวิชาการด้านการเกษตรสุขภาวะเพื่อเผยแพร่องค์ความรู้ นวัตกรรม เทคโนโลยี สู่สังคมประเทศ และสร้างทักษะวิชาชีพจากฐาน การเกษตรแก่บัณฑิต เกษตรกร ประชาชนที่สนใจเรียนรู้ตลอดชีวิตที่สามารถแข่งขันได้ และมีความมั่นคงจากฐานการเกษตรยั่งยืน
4. ส่งเสริมสนับสนุนการทำนุบำรุงศาสนา ศิลปะ วัฒนธรรม และสิ่งแวดล้อม เพื่อการอนุรักษ์การพัฒนาคุณค่า และความยั่งยืน
5. พัฒนาระบบการบริหารจัดการมหาวิทยาลัยแม่โจ้-ชุมพร สู่เมืองแห่งการเรียนรู้ทางการเกษตรสุขภาวะ เป็นสถาบันอุดมศึกษาคุณภาพที่เป็นเลิศ มี ประสิทธิภาพทางการบริหารจัดการ และมีความมั่นคงทางการเงินการคลัง